Resistensi antibiotik terjadi karena penggunaan obat yang tidak sesuai, dan pembentukan akhir resistensi diberikan oleh seleksi alam. ketika terjadi resistensi antibiotik, bakteri menunjukkan mutasi acak atau spontan pada tingkat genomik, dan mutasi ini selalu menguntungkan organisme karena membuatnya bertahan hidup dalam kondisi yang tidak menguntungkan, yaitu ketika obat antibiotik tersedia. Jadi, kita dapat mengatakan bahwa mutasi di sini tidak mematikan. Ketika kita berbicara tentang resistensi antibiotik, kita melihat adanya akumulasi gen yang bermutasi tidak mematikan pada bakteri dengan meneruskan gen tersebut ke generasi berikutnya dari waktu ke waktu. Gen yang membuatnya resisten dapat berupa gen plasmid atau gen kromosom, tergantung pada mutasinya, tetapi sebagian besar kita melihat gen resisten ditemukan pada plasmid. Jadi dengan cara ini kita akhirnya memiliki bakteri yang resisten. Bakteri yang telah memiliki gen resisten mentransfer gen tersebut ke generasi berikutnya melalui dua metode, pertama adalah transfer gen vertikal dan yang lainnya adalah transfer gen horizontal.Dalam transfer gen vertikal, prosesnya dilakukan melalui replikasi, yaitu ketika bakteri membelah menjadi dua. Sesangkan Dalam transfer gen horizontal, ada tiga jenis: translasi, konjugasi, dan transformasi. Jadi, dalam semua proses ini, kita melihat elemen genetik bergerak terlibat, yang meliputi plasmid, bakterioid, dan transposon. 

Mekanisme resisten : 

- pertama adalah inaktivasi obat atau modifikasi obat. Dalam inaktivasi atau modifikasi obat, obat tersebut dinonaktifkan oleh beberapa mekanisme atau dimodifikasi menjadi struktur baru sehingga tidak dapat bekerja seperti semula. dalam inaktivasi atau modifikasi obat, gen resisten bakteri yang ada dalam bakteri menghasilkan zat penangkal antibiotik. Zat penangkal ini, yang pada dasarnya adalah protein yang terbuat dari gen resisten, mampu menonaktifkan antibiotik atau menghindari antibiotik dengan mudah, sehingga bakteri tetap tidak berubah atau tidak terpengaruh. Beta diproduksi oleh strain bakteri yang menonaktifkan penisilin. 

- Kemudian mekanisme kedua, yaitu perubahan target atau tempat pengikatan antibiotik. Dalam mekanisme ini, tempat target antibiotik diubah sehingga antibiotik tetap tidak memengaruhi bakteri. Dalam hal ini, bakteri tidak ditargetkan oleh antibiotik karena antibiotik tersebut tetap bertanya-tanya mengapa harus mengikat dan mengapa tidak. Kondisi ini telah terlihat pada Staphylococcus aureus yang resisten terhadap metin, di mana PBP (tempat pengikatan penisilin) diubah dan antibiotik tidak dapat mengikatnya. 

- Mekanisme terakhir yang mencakup refluks aktif. Dalam refluks aktif, racun, bahan asing, dan obat-obatan dari sel bakteri dihilangkan dari sel. Jadi, ketika ada antibiotik di lingkungan, gen yang mengkode protein pompa refluks secara alami diseleksi dari waktu ke waktu, atau gen lain karena ini memberi bakteri keunggulan. Setelah itu, terjadi peningkatan atau ekspresi protein pompa refluks. Dan akhirnya, kita melihat ketika ada lebih banyak pompa di dalam sel, berarti akan ada lebih banyak masuknya antibiotik ke dalam sel bakteri. bertahan hidup dan ini juga membantu resistensi antibiotik pada bakteri. 

Semua mekanisme resistensi antibiotik ini tidak terjadi dalam satu hari, tetapi membutuhkan waktu puluhan atau bahkan ratusan tahun karena evolusi selalu bertahap.